资本折旧和公司间接税是GNP与NI计算之间的关键差异项，因此选项A和C会直接影响NI与GNP的差异。转移支付是NI与个人收入（PI）之间的调整项，影响NI，但不直接影响GNP。政府支出是GNP的一部分，不直接影响NI与GNP的差异。直接税通常是指对个人的税收，影响PI而不是NI本身。因此选项B和E是正确的，不会直接影响GNP与NI之间的差异。